Did you know traits like milk yield, Conformation, Rump and Calving Ability aren’t included in the LPI?
Do you feel these traits are important in your sire selection and herd improvement program and SHOULD be included in the LPI formula? Allow us to put your mind at ease – just because some traits aren’t included in an index like the LPI doesn’t mean you won’t make progress for them when selecting for LPI. How is this possible?
Correlations Explained
Examples of correlations can be found everywhere. When a correlation between two things is positive, then as one changes, the other will change in the same direction. In the examples from the auto industry below, as accidents increase, so does the cost of insurance. When a negative correlation exists between two things, then as one increases, the other decreases, as seen below with vehicle mileage and value. In cases when there is no clear relationship between two things, the correlation will be zero, or very close to it.
Figure 1: Examples of Positive, Negative and Zero Correlation 
Genetic correlations tell us how much of the genetic influence on two traits is common to both. If the correlation is above zero, this suggests that the two traits are influenced by common genes. Genetic correlations are important because if two traits are genetically correlated, selection for one will cause genetic change for the other as well, and this change could be either desirable or undesirable.
Genetic Correlations and Why They Matter
Estimated genetic correlations among traits, based on official Canadian proofs for Holstein sires, can be seen in Table 1. In this table desirable correlations that are 10% or higher are identified in green while negative correlations below 10% are labeled in red. Basically, correlations that are within 10% from zero are considered not significant. When looking at the box including production traits, it is clear to see that yields are quite highly correlated, especially milk and protein yields, but milk yield is negatively correlated to its components. The same can been seen in the quadrant showing the correlations among the five major type traits, which are all positive. In cases such as these, genetic selection for any one of these traits will also result in a positive correlated response for the others as well.
When looking down the column and across the row for Daughter Fertility (DF), you will see that it is negatively correlated with the yields of milk, fat and protein as well as overall Conformation and Dairy Strength. This antagonistic relationship between production yields and fertility is not new. Until fairly recently, dairy cattle breeding schemes in North America and worldwide focused primarily on selection for increased production yields. While great progress was made, an undesirable side effect was reduced fertility in our dairy populations. Not paying attention to the negative correlation between these two traits contributed to the reduced fertility.
Genetic evaluations for Daughter Fertility were first introduced in November 2004 and it became part of the LPI formula soon thereafter in February 2005. As a result of selection decisions based on LPI during the past decade, the downward genetic trend for Daughter Fertility has been brought to a halt while still achieving positive gains for production traits. An index like the LPI allows for simultaneous selection of important traits like production yields and Daughter Fertility such that, with appropriate weights placed on each trait, genetic progress can occur for both despite their negative genetic correlations.
Weights on Traits or Response to Selection?
The LPI is an index made up of weighted traits, with weights adding up to 100. The traits included in the current Holstein LPI formula, and the relative weight on each, are shown in the top portion of Figure 2. The bottom portion presents the response for each trait that is expected based on selection for LPI. The weights placed on the various traits included in the LPI formula don’t translate directly into selection response. The reason, again, is because of correlations among traits. Even though traits like milk yield, Conformation, Rump and Calving Ability are not in the LPI formula, selection for LPI will result in progress for them.
Our industry spends a great deal of time focusing on which traits get included in the LPI, as well as the relative weights placed on those traits. Clearly, this has led to confusion about breed goals and where we can expect to make progress. Over the upcoming months, discussions about updating the LPI formula as well as consideration of a new profit index will continue. Going forward, extension efforts will focus on the response expected for each trait resulting from selection for an index. After all, index traits and weights look nice on paper, but the response is what will lead to true progress in your herd.
Authors: Lynsay Beavers, Industry Liaison Coordinator, CDN Brian Van Doormaal, General Manager, CDN
La pondération des caractères : ce que vous voyez n’est pas la realité!
Saviez-vous que les caractères tels que le rendement en lait, la Conformation, la Croupe et l’Aptitude au vêlage ne sont pas inclus dans l’IPV? Pensez-vous que ces caractères sont importants dans votre sélection de taureaux et votre programme d’amélioration du troupeau et qu’ils DEVRAIENT être inclus dans la formule d’IPV? Permettez-nous de vous rassurer – ce n’est pas parce que certains caractères ne sont pas inclus dans un indice comme l’IPV que vous ne réaliserez pas de progrès en ce qui les concerne lors de votre sélection en fonction de l’IPV. Comment cela est-il possible?
Explications à propos des corrélations
On retrouve des exemples de corrélations partout. Lorsqu’une corrélation entre deux choses est positive, alors à mesure qu’une d’elles change, l’autre change dans le même sens. Dans les exemples tirés de l’industrie automobile ci-dessous (Figure 1), à mesure que le nombre d’accidents augmente, il en va de même pour le coût des primes d’assurance. Lorsqu’une corrélation négative existe entre deux choses, alors à mesure que l’une d’elles augmente, l’autre diminue, comme le démontre la corrélation entre le kilométrage et la valeur d’un véhicule. Dans les cas où il n’y a pas de relation claire entre deux choses, la corrélation sera nulle ou très près de zéro.
Figure 1 : Exemples de corrélation positive, négative et nulle
Les corrélations génétiques nous indiquent à quel point l’influence génétique de deux caractères est commune aux deux. Si la corrélation est supérieure à zéro, cela suggère que les deux caractères sont influencés par des gènes communs. Les corrélations génétiques sont importantes parce que si deux caractères sont génétiquement corrélés, la sélection d’un de ces deux caractères occasionnera aussi un changement génétique chez l’autre, et ce changement pourrait être souhaitable ou non souhaitable.
Les corrélations génétiques et pourquoi elles sont importantes
Les corrélations génétiques estimées entre les caractères, basées sur les épreuves canadiennes officielles des taureaux Holstein, sont démontrées au Tableau 1. Dans ce tableau, les corrélations souhaitables qui sont de 10 % ou plus sont identifiées en vert alors que les corrélations négatives inférieures à 10% sont illustrées en rouge. Essentiellement, les
corrélations qui se situent à moins de 10 % de zéro ne sont pas jugées importantes. Lorsqu’on regarde la section qui inclut les caractères de production, on voit bien que les rendements sont en étroite corrélation, particulièrement les rendements en lait et en protéine, mais que le rendement en lait est négativement corrélé à ses composants. On peut observer la même situation dans le quadrant indiquant les corrélations entre les cinq principaux caractères de conformation, qui sont toutes positives. Dans de tels cas, la sélection génétique pour n’importe quel de ces caractères entraînera également une réponse positivement corrélée pour les autres. 
Si vous suivez la colonne et la rangée de la Fertilité des filles (FF), vous verrez que ce caractère présente une corrélation négative avec les rendements en lait, en gras et en protéine ainsi qu’avec la Conformation et la Puissance laitière. Cette relation antagoniste entre les rendements en production et la fertilité n’est pas nouvelle. Jusqu’à récemment, les programmes d’élevage des bovins laitiers en Amérique du Nord et dans le monde portaient essentiellement sur la sélection en fonction de l’augmentation des rendements en production. Bien que de grands progrès aient été réalisés, un effet secondaire indésirable a été la réduction de la fertilité dans nos populations laitières. Le fait de ne pas accorder d’attention à la corrélation négative entre ces deux caractères a contribué à la réduction de la fertilité.
Les évaluations génétiques de la Fertilité des filles ont été publiées pour la première fois en novembre 2004 et elles ont été intégrées à la formule d’IPV peu après en février 2005. En raison des décisions de sélection basées sur l’IPV au cours de la dernière décennie, la tendance génétique à la baisse pour la Fertilité des filles a pris fin alors que des gains positifs ont continué d’être réalisés pour les caractères de production. Un indice comme l’IPV permet d’effectuer une sélection simultanée de caractères importants tels que les rendements en production et la Fertilité des filles de façon à ce que si des poids appropriés sont accordés à chaque caractère, le progrès génétique peut survenir pour les deux, malgré leurs corrélations génétiques négatives.
Poids relatifs sur les caractères ou réponse à la sélection?
L’IPV est un indice composé de caractères pondérés, avec des poids s’additionnant jusqu’à 100. Les caractères inclus dans la formule d’IPV Holstein actuelle, et l’importance relative accordée à chacun, apparaissent dans la portion supérieure de la Figure 2. La portion inférieure
présente la réponse pour chaque caractère attendue en fonction de la sélection pour l’IPV. Les poids relatifs accordés aux différents caractères inclus dans la formule d’IPV n’entraînent pas directement une réponse de sélection. Là encore, la situation s’explique par les corrélations entre les caractères. Bien que les caractères tels que le rendement en lait, la Conformation, la Croupe et l’Aptitude au vêlage ne figurent pas dans la formule d’IPV, la sélection en fonction de l’IPV permettra de réaliser des progrès pour ces caractères. 
Notre industrie consacre beaucoup de temps à déterminer quels caractères devraient être inclus dans l’IPV et quelle importance relative devrait être accordée à ces caractères. Cela a clairement créé de la confusion quant aux objectifs de la race et ce à quoi nous pouvons nous attendre pour réaliser des progrès. Au cours des prochains mois, nous poursuivrons les discussions sur la mise à jour de la formule d’IPV ainsi que sur l’étude d’un nouvel indice de profit. À l’avenir, les efforts de vulgarisation seront concentrés sur la réponse attendue pour chaque caractère résultant de la sélection en fonction d’un indice. Après tout, les caractères à indices et les pondérations paraissent bien sur papier, mais la réponse est ce qui permettra d’accomplir de réels progrès dans votre troupeau.
Auteurs : Lynsay Beavers, coordonnatrice de la liaison avec l’industrie, CDN Brian Van Doormaal, directeur général, CDN